Ein weiterer Schwerpunkt der Hagen Engineering ist die Produktion von Prototypen und kleinen Serien. Wird ein Bauteil nur in sehr geringer Stückzahl benötigt, sind die Rüstkosten meist sehr hoch und mindern den Ertrag erheblich. In solchen Fällen übernimmt die Hagen Engineering die Produktion und teilweise auch die Entwicklung dieser Bauteile. Neben der Zeit- und Kosteneinsparung können so auch Kapazitätsengpässe in der Produktion überbrückt werden.

Neben der Fertigung von Kleinserien bietet die Hagen Engineering auch die Herstellung erster Prototypenserien an. Dabei garantieren kurze Wege über die hausinterne Konstruktionsabteilung und den Werkzeugbau eine termingerechte und fachlich korrekte Auslegung des Werkzeuges. So wurden im Technikum beispielsweise unter Variation verschiedener Verfahrensparameter Prototypenserien gefertigt und beim Kunden Funktionstests unterzogen. In einem iterativen Verbesserungsprozess ergänzen sich die Kompetenzen des Kunden mit dem Know-How der Hagen Engineering.

Um darüber hinaus das Wissen aus dem Entwicklungsprozess auch in die Serie zu übertragen, stehen dem Kunden die Mitarbeiter der Hagen Engineering auch nach dem Projektabschluss als Vermittler beim Anlauf der Serienproduktion, bei gezielten Schulungen von Mitarbeitern und in Optimierungsfragen zur Verfügung.